Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh15P33146 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms