Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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P18529 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18529 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18529 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18529 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18529 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18529 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18529 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18529 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18529 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms