Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsdP18242 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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