Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Myod1P10085 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Myod1P10085 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Myod1P10085 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms