Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms