Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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