Protein–RNA interactions for Protein: P02301

H3f3c, Histone H3.3C, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3cP02301 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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H3f3cP02301 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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H3f3cP02301 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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H3f3cP02301 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H3f3cP02301 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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