Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01820 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01820 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01820 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01820 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01820 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01820 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01820 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01820 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01820 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01820 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01820 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01820 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01820 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01820 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01820 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms