Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snap23O09044 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms