Protein–RNA interactions for Protein: O09010

Lfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LfngO09010 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LfngO09010 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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LfngO09010 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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LfngO09010 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LfngO09010 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LfngO09010 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms