Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms