Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp35M0QWN7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp35M0QWN7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp35M0QWN7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp35M0QWN7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp35M0QWN7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp35M0QWN7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp35M0QWN7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp35M0QWN7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp35M0QWN7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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