Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm20939L7N243 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm20939L7N243 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm20939L7N243 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm20939L7N243 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm20939L7N243 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm20939L7N243 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm20939L7N243 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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