Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gm21818J3KMS6 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gm21818J3KMS6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gm21818J3KMS6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gm21818J3KMS6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21818J3KMS6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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