Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Rnf148G3X9R7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf148G3X9R7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf148G3X9R7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf148G3X9R7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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