Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Phf11bB4XVQ1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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