Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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