Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms