Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd1A2AKB4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms