Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pramef6A2A8M8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pramef6A2A8M8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pramef6A2A8M8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pramef6A2A8M8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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