Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms