Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
2210011C24RikA0A087WQ89 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms