Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms