Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gpc6Q9R087 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gpc6Q9R087 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gpc6Q9R087 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gpc6Q9R087 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gpc6Q9R087 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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