Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Col4a4Q9QZR9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Col4a4Q9QZR9 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Col4a4Q9QZR9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Col4a4Q9QZR9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Col4a4Q9QZR9 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Col4a4Q9QZR9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Col4a4Q9QZR9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Col4a4Q9QZR9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Col4a4Q9QZR9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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