Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Tnnt3Q9QZ47 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Tnnt3Q9QZ47 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Tnnt3Q9QZ47 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Tnnt3Q9QZ47 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Tnnt3Q9QZ47 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Tnnt3Q9QZ47 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Tnnt3Q9QZ47 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Tnnt3Q9QZ47 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt3Q9QZ47 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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