Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf19Q9JLL3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms