Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tgm1Q9JLF6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm1Q9JLF6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms