Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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