Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Wdr61Q9ERF3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms