Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Clstn2Q9ER65 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn2Q9ER65 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms