Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms