Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ftsj3Q9DBE9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms