Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Smg9Q9DB90 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Smg9Q9DB90 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Smg9Q9DB90 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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