Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gtf3c6Q9D8P7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gtf3c6Q9D8P7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gtf3c6Q9D8P7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gtf3c6Q9D8P7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gtf3c6Q9D8P7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gtf3c6Q9D8P7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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