Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms