Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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