Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc3Q9CWU5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms