Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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