Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms