Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms