Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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