Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms