Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms