Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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