Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms