Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms