Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms