Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trub2Q91WG3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trub2Q91WG3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms