Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms